自从盘尼西林发现以来，抗生素用来做抗病原微生物的主要手段，但物极必反，近来有抗药性的细菌愈来愈顽强，如抗甲氧西林金黄色葡萄球菌（MRSA），抗万古微粪肠球菌（VRE） （V=Vancomycin 一度是终极版的抗生素）在人菌大战中，人定胜菌还是遥远的目标，且抗生素疗法，也有严重的不良后果，好菌坏菌都不分青红皂白的通杀。

胃肠道事实上是人类重要的免疫系统，胃肠道内还存着一群和人类平共生的「益生菌」（Probiotics），早在1907年，俄罗斯的梅奇尼科天的「长寿论」，提出人体消化道下部栖息着可引发自身中毒的蛋白质分解性细菌（如死后的胃肠道腐败），为防止此后果，摄取酸奶中糖分解性乳酸细菌可抑制自身中毒进而获得长寿。

小儿科医师也很早注意到，母乳喂养，可增加抵抗力。1899年巴斯德研究所的蒂歇尔医师，从母乳喂养儿的大便中分离出「双歧杆菌」（Bacillus Bifidus Communis），确立了肠内菌群的观念。

什么是「菌生菌」？福勒1989年提出「通过改善肠内菌群的平衡，宿主发有益作用的活微生物」 与人和平共处的细菌，何其多？你知道１克成人粪便中有千亿个以上的细菌，菌种有数百个，（其中以厌氧菌群占优势）